栽培的藥用植物除蓮、澤瀉、芡實等要求有一定的水層外，絕大多數植物主要靠根從土壤中吸收水分。在土壤處在正常含水量的條件下，根系入土較深，在潮濕的土壤中，藥用植物根系發育不發達，多分布在淺層土壤中，生長緩慢，特別是一些根莖類藥用植物，常因此而發生病害，如延胡索、白朮等的菌核病等，大都是由於水分過多、濕度過大而引起的。
通常根據藥用植物對水分的不同要求，分為旱生、水生、濕生、中生幾類。
（１）旱生植物 在乾旱環境中生長，能忍受較長時間乾旱而仍能維持水分平衡和正常生長發育的一類植物。在乾熱的草原和荒漠地區，旱生植物的種類特別豐富。旱生植物中又可分為多漿液植物（仙人掌、蘆薈、景天科的植物等）和少漿液植物（麻黃）和深根性植物。
（２）濕生植物 在潮濕環境中生長，不能忍受較長時間的水分不足，抗旱能力最小的陸生植物。根據環境的特點還可以分為陰性濕生植物（弱光，大氣潮濕）和陽性濕生植物（強光，土壤潮濕）兩大類。前者如各種秋海棠、蕨類；後者如燈心草、半邊蓮、毛茛等。
（３）中生植物 是生長在水濕條件適中的陸上植物。大多數栽培藥用植物屬於此類型。
（４）水生植物 生長在水中的植物統稱為水生植物。又可分為沉水植物、浮水植物、挺水植物。如澤瀉、蓮、芡實等。
同一種藥用植物在不同的生長發育階段，對水分的要求也不相同，因此在引種栽培過程中，還要進一步掌握藥用植物不同生育時期對水分的要求，才能有效地制定灌溉排水措施。如川芎前期喜濕，後期喜乾；薏苡開花結實期不能缺水等。
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