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| 1. | 鎖港漁港(2002/10/25) | | 鎖港漁港屬第三類漁港，位於澎湖縣馬公市鎖港里，在天然之內灣內， 具有建港優良地形，為馬公島南部之中心漁港。 |
| 2. | 案山漁港(2002/10/25) | | 案山漁港屬第四類漁港，位於澎湖島西南內灣，臨馬公漁港修造船區南堤外緣，行政區域劃分為馬公市。 |
| 3. | 烏崁漁港(2002/10/25) | | 烏崁漁港屬第四類漁港，位於澎湖縣鎖港漁港北方約二公里，海岸線平直缺乏天然遮蔽，沿岸淺灘為砂質，外海為珊瑚礁，因面向南方，故颱風波浪甚大。 |
| 4. | 前寮漁港(2002/10/25) | | 前寮漁港屬第三類漁港，位處澎湖島西南內灣北岸，行政區域劃分為馬公市。本港為東西兩道防波堤圍成之港域，防波堤並兼作泊靠碼頭。 |
| 5. | 重光漁港(2002/10/25) | | 重光漁港屬第三類漁港，位處澎湖島北岸，面臨由三大島圍成之內海，馬公漁港與西衛漁港之間。 |
| 6. | 西衛漁港(2002/10/25) | | 西衛漁港屬第三類漁港，位處澎湖島北岸灣澳內，屬馬公市管轄，漁港設施皆較附近重光、安宅等漁港完善，因此除可供為區里漁業基地外，建設本港亦可兼顧附近漁港，提供其停駐較大型漁船停泊避風。 |
| 7. | 風櫃東漁港(2002/10/25) | | 本漁港係以繫泊近、沿海 20 噸以下之漁船為主，現有漁船百餘艘，因距馬公港較近，漁船加油、補給及銷售均在馬公漁港為之。 |
| 8. | 桶盤漁港(2002/10/25) | | 桶盤漁港屬第四類漁港，位於馬公及虎井嶼間之岩石小島桶盤嶼的北面，臨澎湖灣口。 |
| 9. | 五德漁港(2002/10/25) | | 五德漁港屬第四類漁港，位處澎湖島西南內灣之南岸，行政區域劃分為馬公市，「澎湖縣港澳整體發展評估規劃」中將本港列為區里船筏漁業基地， 區內養殖業發達。 |
| 10. | 石泉漁港(2002/10/25) | | 石泉漁港屬第四類漁港，位於澎湖縣馬公市之內灣，面向南方，菜園漁港與前寮漁港之間。 |
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