糞便的乾與稀與其所含水量有關。食物在胃腸道內消化吸收過程中，水分的吸收主要在小腸和大腸完成。正常人一般每天經過十二指腸的液體（包括飲食、唾液、胃液、膽汁、胰液、腸液等）可達9升之多，而到達大腸的液體只剩1升左右，糞便內水分僅有0.1～0.5升左右。大約90%的水分在小腸被吸收，大腸通過協調規則的"分節運動"和"前伸運動"繼續吸收水分，使糞便逐步成形並進入乙狀結腸和直腸。正常情況下，腸道按一定的節律和速度完成對飲食的消化吸收功能，保持大便正常。如果腸道蠕動過快、腸內容物的水分來不及被吸收就被排出體外，大便就變稀；如果腸道蠕動過緩或處於痙攣狀態，腸內容物在腸道內停滯時間過長，水分被過度吸收，糞便則變乾燥，導致便秘。
腸躁症及部分腸結核病人可出現便秘與腹瀉交替出現現象。因為腸道運動功能紊亂，有時食物通過過快，有時食物通過過慢。
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